ググると
class ActiveRecord::ConnectionAdapters::AbstractMysqlAdapter NATIVE_DATABASE_TYPES[:datetime][:limit] = 6 end
と書いた ruby ファイルを config/initializers の下に置けば良い、という情報が手に入りましたが、これだけですと、
NameError: uninitialized constant ActiveRecord::ConnectionAdapters::AbstractMysqlAdapter::NATIVE_DATABASE_TYPES
と怒られてしまいますので、
require 'active_record/connection_adapters/abstract_mysql_adapter' class ActiveRecord::ConnectionAdapters::AbstractMysqlAdapter NATIVE_DATABASE_TYPES[:datetime][:limit] = 6 end
としてあげると、うまくいきました。